ولد أحمد أمين مرعشلي في صفد، ودرس المرحلتين الابتدائية والإعدادية في مدارسها، ثم انتقل إلى الكلية الإبراهيمية في القدس ليتابع دراسته الثانوية فأتمها عام 1947؛ عمل مدرساً لمادة العلوم في مدرسة صفد الثانوية عامي 1947 – 1948، وفي عام 1948 شارك في الدفاع عن صفد إلى أن احتلها اليهود؛ فانتقل إلى سورية وعمل في حقل التدريس في إعدادية بلدة السلمية (حماة) وفي ثانويات مدينة حمص حتى عام 1958؛ وفي أثناء ذلك درس الحقوق في جامعة دمشق، وحصل على شهادتها عام 1958.
انتسب أحمد مرعشلي إلى حزب البعث الاشتراكي عام 1949، وأسهم في نضال الحزب في السنوات الأولى لتأسيسه، ووصل إلى مناصب قيادية فيه.
تولى رئاسة دائرة التوجيه التعاوني ودائرة العلاقات الزراعية في الإدارة المركزية بوزارة الشؤون الاجتماعية والعمل بدمشق خلال الفترة 1959 – 1964م؛ كما تولى منصب المدير العام للهيئة العامة للاجئين الفلسطينيين في سورية ورئاسة مجلس إدارتها في الفترة 1964 – 1966م.
انتخب عضواً في اللجنة التنفيذية لمنظمة التحرير الفلسطينية ورئيساً لدائرة التربية والتعليم العالي (دائرة الشؤون التربوية والثقافية سابقاً) في الفترة من 1971 – 1973، ثم مديراً عاماً لدائرة التربية والتعليم العالي في الفترة من 1973 – 1981؛ إضافة لإنتخابه ممثلاً لفلسطين قي المجلس التنفيذي للمنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم بين عامي 1971 – 1981، وترأس وفد فلسطين إلى الدورة الثامنة عشرة لليونسكو في باريس عام 1974، والتي قبلت فيها منظمة التحرير الفلسطينية عضواً مراقباً لأول مرة.
كان عضواً في المجلس الإداري لمركز التنسيق بين اللجان الوطنية العربية بين عامي 1978 – 1981؛ وكان له الفضل الكبير والدور البارز في إنشاء هيئة الموسوعة الفلسطينية عام 1974؛ وتولى رئاسة مجلس الإدارة منذ إنشائها حتى وفاته.
وتقديراً لجهوده في المجالات العلمية والثقافية والتربوية ودوره في إنشاء وتطوير المنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم من خلال مشاركته في المجلس التنفيذي ومن موقعه مديراً عاماً لدائرة التربية والتعليم العالي؛ منحته المنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم الميدالية الفضية في احتفال رسمي خلال جلسة المؤتمر العام في كانون الأول/ ديسمبر 1981.
توفي وهو في قمة عطائه الثقافي والفكري في دمشق في 16 كانون الثاني 1988 إثر نوبة قلبية مفاجئة.